員林舊稱『林仔街』，員東路教會位於員林鎮東邊，介於市區與郊區的中間。1989年3月29日長老教會鄧新穎、鄧莊貞惠長老夫婦與家族憑著奉獻的熱誠，於1990年3月29日在這個上帝應許之地上興建了員東路教會。1992年地方教會靈糧堂，積極商借聖殿事宜，並於1996年歸還員東路教會。隔年藉聖約翰教會與員東路教會締結母會與支會的關係，成為台灣基督長老教會的一員。
1997年施金寶牧師派駐前來員東路教會牧會，1999年施金寶牧師退休。2000年得大同教會協助接替聖約翰教會為員東路教會母會。該年八月劉德行牧師就任派駐員東路教會牧師，時值政府農發條例變更，受託處理教堂及土地歸屬總會財團法人事宜。翌年(2001年9月19日)終於完成歸屬台灣基督長老教會總會財團法人。
教會在開拓初期經歷困難與生澀，當時會友會籍人數雖僅十二人，但耶和華以勒的上帝讓我們永不缺乏，在曠野開道路、在沙漠開江河的上帝更讓我們充滿異象與挑戰，全體弟兄姊妹同感上帝的美意與安排，決意熱心事奉主，全體參與，同甘共苦，興旺福音。
先建立主日學事工，並於社區弱勢兒童的需要並配合所輔導的大專學生而成立兒童課後輔導班，2000年9月推動國中得勝者事工計畫，並開拓大專學生的關懷與校園宣教事工。2000年11月11日成立聖歌隊與青少年團契。2002年4月14日開始成人主日學。2003年2月12日於東山社區成立東山福音小組。隨著福音的拓展，兄姐人數的增加，漸感教會內教室硬體之不足，於是在2002年3月29日決定進行教會擴建工程，並於2002年6月3日動工，總共四樓；在2003年2月底完工。隨著上帝奇妙的帶領與事工的推展，於2003年3月29日舉行升格堂會、擴建工程落成暨劉德行牧師就任首任牧師三合一感恩禮拜。
2004年二月十一日開始每週至石佛公廟口以『社區健康關懷站』活動進行福音佈道事工，後轉至員林公園繼續進行，風雨無阻，過程雖然艱辛坎坷，但卻訓練造就出一群共同南征北討跟著佈道的初信大專青年，這些青年畢業後在各地都成為教會堅定的福音勇士與棟樑基石，真是「萬事互相效力，叫愛神的人得益處！」該年也積極推動兒童，少年及社區的聖經班課程。2006年5月成立米利暗詩班，有感於弟兄事工的重要性，2009年8月成立男聲合唱團，2009年10月份擴大課輔班的內容並免費提供晚餐給弱勢家庭孩童。
為了關心外國學生的信仰，在2018年4月正式成立「史瓦帝尼學生團契」，另每年為他們及獨居長輩或課輔班學生舉行農曆年「除夕感恩圍爐聚會」，讓他們也能感受到「家」的關心與溫暖。隨著社會的變化，感受台灣高齡長者的需要，每年常會舉辦松年夏令營或是冬令營，反應極為踴躍，於是在2018年七月十八日舉行樂齡班的開站感恩禮拜，為社區成立高齡關懷的據點，長輩因著樂齡班而信主受洗人數也不斷增加。
隨著福音腳步，事工也朝多元發展，2018年4月成立幸福小組，5月27日成立社青團契。每年的幼兒祝福禱告日，主日學升級日，青少年主日，祖父母節主日活動，都配合社會的發展而展開各種可能性，回顧過去從火車站的音樂會演唱到賣場大型聖誕活動，從週末兒童營到年年爆滿的夏令營，從少年聖經班到法院聖經班，從福音講座到中秋節社區大團圓，從跨國界日本優迪亞樂團到斯洛伐克兒童合唱團，上帝那雙看不見的手一再鼓勵扶持每個弟兄姊妹。看見無數對上帝獻上感恩的淚水，見證與奇蹟環繞在這個大家庭中。雖然剛開始人數不多，但大家不分老少，彼此打氣、凝聚力量、團結一致，在教會開拓艱困的時期，實屬可貴！
2021年11月底出版的『林仔街的教會～員東路教會見證集』，厚厚一本記錄弟兄姐妹所寫生命的奇妙故事，見證了在人所不能，在神凡事都能的神蹟！2022年3月將出版這本數十年彙整的拾穗牧函，點點滴滴都是訴說上帝真的是又真又活的神！
員東路教會雖然只有32年的歷史，但卻見證著上帝千古以來不變的愛與真理；它如同一粒芥菜種，看似微小，但卻能長大成樹；也如同五餅二魚的有限，卻因著上帝成就無限；福音本是上帝的大能，要救一切相信的。員東路教會不大，但上帝的愛卻讓一切變得偉大！
願上帝賜福你！(註)2022年32週年